Kegiatan pembelajaran di Madrasah Mu’allimaat Muhammadiyah Yogyakarta terbagi menjadi 2, yaitu:
1. Kegiatan pembelajaran di sekolah/ madrasah.
2. Kegiatan pembelajaran di asrama.
Kegiatan pembelajaran di Madrasah Mu’allimaat Muhammadiyah Yogyakarta terbagi menjadi 2, yaitu:
1. Kegiatan pembelajaran di sekolah/ madrasah.
2. Kegiatan pembelajaran di asrama.